Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GTF2H3Q13889 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms