Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ALCAMQ13740 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms