Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
CUL4BQ13620 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL4BQ13620 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms