Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD8P13378 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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