Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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PTPRCP08575 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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PTPRCP08575 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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PTPRCP08575 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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PTPRCP08575 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTPRCP08575 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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