Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
LRRTM2O43300 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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