Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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RFXAPO00287 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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