Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
LTBP4Q8N2S1 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LTBP4Q8N2S1 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms