Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms