Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP41Q3LFD5 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms