Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 SETBP1-201ENST00000282030 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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LAMA3Q16787 KCNB1-201ENST00000371741 11879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 ARNT2-207ENST00000533983 6690 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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LAMA3Q16787 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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LAMA3Q16787 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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LAMA3Q16787 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
LAMA3Q16787 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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