Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USF2Q15853 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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