Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PUM3Q15397 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PUM3Q15397 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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