Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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BRD3Q15059 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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BRD3Q15059 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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BRD3Q15059 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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BRD3Q15059 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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BRD3Q15059 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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BRD3Q15059 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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BRD3Q15059 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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