Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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CHD4Q14839 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHD4Q14839 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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