Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATP1A4Q13733 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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