Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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