Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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CHAF1BQ13112 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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