Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CHAF1AQ13111 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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