Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PGGT1BP53609 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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