Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
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PTPRGP23470 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PTPRGP23470 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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