Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01142-201ENST00000440404 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC073525.1-203ENST00000547040 2631 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM49-202ENST00000532501 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC109454.1-201ENST00000471205 498 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC009269.1-202ENST00000484381 469 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC63-204ENST00000552694 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF887P-201ENST00000431363 1407 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms