Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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SGF29Q96ES7 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SGF29Q96ES7 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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SGF29Q96ES7 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SGF29Q96ES7 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SGF29Q96ES7 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SGF29Q96ES7 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
SGF29Q96ES7 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SGF29Q96ES7 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SGF29Q96ES7 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SGF29Q96ES7 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SGF29Q96ES7 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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