Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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SYCP1Q15431 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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SYCP1Q15431 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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SYCP1Q15431 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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SYCP1Q15431 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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SYCP1Q15431 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SYCP1Q15431 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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