Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PSMD6Q15008 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PSMD6Q15008 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms