Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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