Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATP1A4Q13733 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms