Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PTCH1Q13635 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTCH1Q13635 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTCH1Q13635 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTCH1Q13635 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PTCH1Q13635 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PTCH1Q13635 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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PTCH1Q13635 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PTCH1Q13635 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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