Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NEUROD1Q13562 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms