Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL162595.2-201ENST00000430677 792 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RPS10P3-201ENST00000439253 494 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC008026.1-201ENST00000460492 447 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC006299.1-203ENST00000499625 2029 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PRB4-203ENST00000535904 796 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CHURC1-202ENST00000548752 439 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC007375.2-201ENST00000557752 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AP001017.1-201ENST00000591378 482 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC233702.11-201ENST00000598588 333 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PRYP3-202ENST00000607210 444 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC215522.1-201ENST00000615488 446 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 GALNT15-206ENST00000617544 2775 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CNR2-201ENST00000374472 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 MET-202ENST00000397752 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 MAPT-AS1-204ENST00000634876 3602 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 UTY-201ENST00000329134 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 TCAF1-201ENST00000355951 3343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LINC01915-201ENST00000577994 2321 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 IGSF1-206ENST00000370910 4406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 NTNG2-201ENST00000372179 3984 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SSX2B-204ENST00000616191 1344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 TTC33-205ENST00000636106 2252 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 DIS3L-201ENST00000319194 3763 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ZNF250-201ENST00000292579 6364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 CDY22P-201ENST00000451423 1554 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 HELQ-204ENST00000510985 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ZNF259P1-202ENST00000572422 4912 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SCNM1-201ENST00000368902 869 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 TRIB2-203ENST00000405331 830 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 SPATA24-203ENST00000451821 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC119424.1-201ENST00000472513 350 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC008481.2-201ENST00000483614 531 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC022973.1-201ENST00000490340 575 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 RN7SL653P-201ENST00000494134 293 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 GAPDHP35-201ENST00000513369 976 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 FDPSP4-201ENST00000534629 1049 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC084816.1-211ENST00000540994 485 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC018618.1-202ENST00000559590 395 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AC138907.5-201ENST00000561744 273 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ARPP19-213ENST00000569723 550 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 uc_338.30-201ENST00000612038 168 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ALG13-226ENST00000622986 582 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 LINC01358-207ENST00000634502 2575 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PROX2-202ENST00000556489 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 KAT6A-208ENST00000485568 3592 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ZSCAN30-201ENST00000333206 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 ZSCAN20-201ENST00000361328 4316 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PAN2-203ENST00000440411 4576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
MKRN4PQ13434 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms