Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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TRAF1Q13077 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRAF1Q13077 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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