Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXC9P31274 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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