Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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PTPRMP28827 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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PTPRMP28827 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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PTPRMP28827 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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PTPRMP28827 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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PTPRMP28827 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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PTPRMP28827 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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PTPRMP28827 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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