Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PTPRGP23470 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
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