Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EHD3Q9NZN3 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.8 ms