Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms