Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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RTL8BQ17RB0 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RTL8BQ17RB0 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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