Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 USP6-205ENST00000574788 8464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 PCDHA10-203ENST00000562220 12358 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 PRICKLE1-213ENST00000639589 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SEMA5A-201ENST00000382496 11762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 TBC1D15-217ENST00000550746 6184 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
LAMA3Q16787 SPATA31D3-201ENST00000445385 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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