Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
USF2Q15853 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
USF2Q15853 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
USF2Q15853 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USF2Q15853 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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