Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CCDC85BQ15834 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms