Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
BRD3Q15059 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms