Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.8 ms