Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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