Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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FOXE3Q13461 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXE3Q13461 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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