Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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IFT88Q13099 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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IFT88Q13099 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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