Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF2Q12947 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms