Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 NAIP-208ENST00000517649 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BPTFQ12830 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms