Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ERVPABLB-1P60509 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms