Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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NFKB1P19838 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NFKB1P19838 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NFKB1P19838 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NFKB1P19838 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NFKB1P19838 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NFKB1P19838 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NFKB1P19838 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NFKB1P19838 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NFKB1P19838 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NFKB1P19838 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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