Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 OR5P3-201ENST00000328375 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 Z99943.2-201ENST00000507585 266 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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LINC00587B1AMM8 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
LINC00587B1AMM8 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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